2019年，宝应县共有各类卫生机构33个。其中，医院13个；社区卫生服务中心、乡镇卫生院14个；妇幼保健院1个；专科疾病防治院2个；疾病预防控制中心1个；卫生监督所1个；卫生培训中心1个。各类卫生机构拥有床位3337张，其中医院拥有病床1840张。共有卫生技术人员3816人，其中执业医师、执业助理医师1767人，注册护士1346人。